HLA-DR
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MHC di classe II, DR
(Eterodimero)
DR Illustration.PNG
Illustrazione di DR con il legante legato (giallo)
-
Proteina tipo di cellula recettore di superficie
Il riconoscimento e la funzione immunitaria
presentazione dell'antigene
-
Subunità
Nome del gene cromosomico
Locus
α HLA-DRA Cromosoma 6p21.31
β1 HLA-DRB1 ""
β3 HLA-DRB3 ""
β4 HLA-DRB4 ""
β5 HLA-DRB5 ""
HLA-DR è un complesso maggiore di istocompatibilità, MHC di classe II, recettore sulla superficie cellulare, codificata dal complesso antigene leucocitario umano sul cromosoma 6 6p21.31 regione. Il complesso di HLA-DR e il suo ligando, un peptide di 9 aminoacidi in lunghezza o più a lungo, costituisce un ligando per il recettore delle cellule T (TCR). HLA (antigene leucocitario umano) sono stati originariamente definiti come antigeni di superficie delle cellule che mediano graft-versus-host disease, che ha portato al rigetto del trapianto di tessuto dei donatori HLA-non corrispondenti. L'identificazione di questi antigeni ha portato ad un maggiore successo e la longevità nel trapianto di organi.
HLA-DR è anche coinvolta in numerose condizioni autoimmuni, suscettibilità alle malattie e resistenza alle malattie. E 'anche strettamente legato al HLA-DQ e questo legame, spesso rende difficile risolvere il fattore eziologico più nella malattia.
molecole HLA-DR sono upregulated in risposta alla segnalazione. Nel caso di un'infezione, il peptide (come la peptide enterotossina staphlococcal ho illustrato nei due illustrazioni) è legato in una molecola DR e presentato ad alcuni recettori di un grande numero di cellule T trovato sulle cellule T-helper. Tali cellule quindi associare ad antigeni sulla superficie di cellule B stimolando la proliferazione B-cellulare.
Contenuto
[Nascondi]
* 1 Funzione
* 2 Struttura
* 3 Genetica
o 3.1 Evoluzione e Frequenze alleliche
* 4 Sierogruppi
* 5 Linkage DRB Interlocus
* 6 malattie associate
* 7 Riferimenti
* 8 Altri progetti
* 9 Collegamenti esterni
[Modifica] Funzione
Illustrazione del recettore DR presentare l'antigene di TCR su cellule T-helper
La funzione primaria di HLA-DR è quello di presentare gli antigeni peptidici, potenzialmente di origine straniera, per il sistema immunitario allo scopo di suscitare o all'eliminazione T (helper) a cellule risposte che alla fine portano alla produzione di anticorpi contro l'antigene stesso peptide . Cellule presentanti l'antigene (macrofagi, cellule B e le cellule dendritiche) sono le celle in cui si trovano tipicamente DR. Maggiore abbondanza di antigene DR '' sulla superficie delle cellule è spesso in risposta alla stimolazione, e, quindi, DR è anche un marcatore per la stimolazione immunitaria.
[Modifica] Struttura
HLA-DR è un eterodimero αβ, recettore di superficie delle cellule, ciascuna subunità contiene 2 domini extracellulari, una membrana spanning dominio e una coda citoplasmatica. Sia α e β le catene sono ancorati nella membrana. Il dominio N-terminale delle forme proteina matura uno alfa-elica che costituisce la parte esposta del groove vincolante, la regione C-terminale citoplasmatica interagire con gli altri formando una catena di fogli beta sotto il solco legame si estende alla membrana cellulare. La maggior parte delle posizioni di contatto peptide sono nelle prime 80 residui di ogni catena.
[Modifica] Genetica
La genetica di HLA-DR è complessa. HLA-DR è codificato da più loci e diversi 'geni' della funzione diversa per ogni locus. Il DR α-catena è codificata dal locus HLA-DRA. A differenza del DR altri loci variazione funzionale dei prodotti genici maturo DRA è assente. (Nota: vedi tabella Numero di Variante alleli HLA-DR-Loci riduce le combinazioni possibili funzionale da ~ ~ 1400 a 400 (tabella non è esatto perché gli alleli nuovi vengono continuamente aggiunte non tutti gli alleli di nuove varianti funzionale delle subunità maturo)) .
28 (di 75) La maggior parte dei comuni aplotipi DR-DQ in caucasici americani DR DR-DQ DR DQ Freq
Sierotipo aplotipo A1 B1 B1% [1]
DR1-DR1 DQ5 0.101 0.101 0.501 9. 1
0102 0101 0501 1. 4
0103 0101 0501 0. 5
DR3 DQ2-DR3 0.301 0.501 0.201 13. 1
DR4-DR4 DQ7 0.401 0.300 0.301 5. 4
0407 0300 0301 0. 9
DR4-DQ8 0.401 0.300 0.302 5. 0
0402 0300 0302 1. 0
0403 0300 0302 0. 4
0404 0300 0302 3. 9
0405 0300 0302 0. 3
DR7 DR7-DQ2 0.701 0.201 0.202 11. 1
DR7-DQ9 0.701 0.201 0.303 3. 7
DR8 DR8-DQ4 0.801 0401 0402 2. 2
DR8-DQ7 0.803 0.601 0.301 0. 1
DR9 DR9-DQ9 0.901 0.300 0.303 0. 8
DR10 DR10-DQ5 1.001 0.104 0.501 0. 7
DR11 DR11-DQ7 1.101 0.505 0.301 5. 6
1103 0505 0301 0. 3
1104 0505 0301 2. 7
DR12 DR12-DQ7 1.201 0.505 0.301 1. 1
DR13 DR13-DQ6 1.301 0.103 0.603 5. 6
1302 0102 0604 3. 4
1302 0102 0609 0. 7
DR13-DQ7 1.303 0.505 0.301 0. 7
DR14 DR14-DQ5 1.401 0.104 0.503 2. 0
DR15 DR15-DQ6 1.501 0.102 0.602 14. 2
1502 0103 0602 0. 7
DR16 DR16-DQ5 1.601 0.102 0.502 1. 0
enterotossina legante (stafilococciche 1-C peptide: pkyvkqntlklat) all'interno della tasca di legame DR αβ101
Il [DR β-chain 2] è codificato da 4 loci, e comunque non più di 3 loci funzionali sono presenti in un singolo individuo, e non più di due su un unico cromosoma. A volte una persona può avere solo 2 copie del locus stesso, DRB1 *. Il locus HLA-DRB1 è onnipresente e codifica un numero molto elevato di variabili funzionali dei prodotti genici (HLA-DR1 di HLA-DR17). La codifica locus HLA-DRB3 la specificità HLA-DR52, è moderatamente variabile ed è variabilmente associata con determinati tipi di HLA-DRB1. La codifica locus HLA-DRB4 la specificità HLA-DR53, ha qualche variazione, ed è associata con determinati tipi di HLA-DRB1. Il locus HLA-DRB5 codifica per la specificità HLA-DR51, che in genere è invariabile, ed è legato ai tipi di HLA-DR2.
* Collegamento (vedi tabella)
O DQA1 ed DQB1
+ Linkage disequilibrium esiste per molti tipi DR-DQ.
o questioni di nomenclatura. Alcuni studi precedenti che possono riferirsi alla DR15 o 16 DR2 e DQ5 e DQ6 come DQ1 quindi un aplotipo-DR2 DQ1 è di solito riferimento a DR15-DQ6, ma potrebbe riferirsi a DR16-DQ5. DR5 è usato per riferirsi a DR11 e DR12, nel qual caso DQ3 potrebbero essere utilizzati. In questi casi DQ3 quasi sempre può essere interpretato come DQ7, ma DR5 è più spesso e meno frequentemente DR11 DR12. Problemi simili esistono per DR6 contro DR13 e DR14. DR6-DQ1 può riferirsi sia DR13-DQ6 o meno frequentemente DR14-DQ5, ma DR6-DQ3 o DR6-DQ7 si riferisce generalmente a DR13-DQ7. Anche la letteratura ha grandi denominazioni più confusa. Osservando il cambio di associazione con la malattia di prova migliore che possiamo vedere come la scienza si è evoluta nel tempo.
Numero degli alleli HLA-DR Variant Loci HLA-DR
HLA-A1-B1-B3-B51 Potenziale
Locus # # # Combinazioni
Alleli [2] [3] 3 463 74 1635
Unico polipeptidiche 2 394 57 902
Contatto Variante 1 ~ 300 ~ 30 ~ 330
1DRB3, DRB4, DRB5 hanno una presenza variabile negli esseri umani
[Modifica] Evoluzione e frequenze alleliche
C'è un alto livello di diversità allelica HLA DRB1 a, è secondo solo al locus HLA-B nel numero di varianti alleliche. Questi due loci sono più alto tasso di variazione di sequenza all'interno del genoma umano. Questo significa HLA-DRB1 è in rapida evoluzione, molto più rapidamente di quelle di quasi tutti gli altri la codifica delle proteine loci. Gran parte della variazione di HLA DRB1 si verifica nelle posizioni di contatto peptide nel solco vincolante, in seguito molti degli alleli modificare il modo in cui la DR si lega ligandi peptidici e cambia il repertorio ogni recettore può legare. Questo significa che la maggior parte dei cambiamenti sono di natura funzionale, e quindi sono in fase di selezione. Nella regione HLA, i geni sono sotto eterozigoti o bilanciamento di selezione, anche se alcuni alleli sembrano essere in fase di selezione positivo o negativo, sia nel passato o nel presente
HLA generalmente si evolvono attraverso un processo di conversione genica, che è una forma di passi o 'ricombinazione genetica abortivo. motivi funzionali nei geni vengono scambiati per formare nuovi alleli, e spesso nuovi, funzionalmente differenti isoforme DR. HLA-DR rappresenta un esempio estremo di questo. Un sondaggio di loci X-linked rivela che la maggior parte loci umani siano stati oggetto di fissazione negli ultimi 600 mila anni, e loci diploidi sono stati sottoposti quota significativa di fissazione in quel periodo di tempo.
Il livello di profonda ramificazione in loci X-linked indica loci sono stati vicino alla fissazione o fissato alla fine del collo di bottiglia popolazione umana da 100.000 a 150.000 anni fa. Il locus HLA-DR rappresenta una importante eccezione a questa osservazione [4]. Basato sulla distribuzione dei raggruppamenti principali nella popolazione umana è possibile affermare che più di una dozzina di varianti principali sopravvissuto il collo di bottiglia della popolazione. Questa osservazione è supportata dal concetto di una selezione eterozigote coefficiente di esercizio sulla HLA-DR, e al locus HLA-DRB1 in misura maggiore rispetto a HLA-DQB1 e HLA-DPB1. La maggior parte degli alleli HLA attualmente presenti nella popolazione umana può essere spiegata con la conversione genica tra queste antiche ancestrali [5], alcuni che persistono nella popolazione esistente.
[Modifica Sierogruppi]
Sottopagine di DR sierotipi sierotipi di prodotti gene HLA-DRB1
Split antigeni
HLA-DR1
HLA-DR2 HLA-DR15 HLA-DR16
HLA-DR3 HLA-DR17 HLA-DR18
HLA-DR4
HLA-DR5 HLA-DR11 HLA-DR12
HLA-DR6 HLA-DR13 HLA-DR14
HLA-DR7
HLA-DR8
HLA-DR9
HLA-DR10
La tabella sottostante fornisce link a sottopagine con informazioni sulla distribuzione, il c